Aneuploidia é uma anormalidade cromossômica, caracterizada por uma variação no número normal de cromossomos presentes dentro de uma célula de uma determinada espécie.
No que diz respeito ao ser humano, um sujeito com mais ou menos cromossomos é considerado aneuploide, comparado ao número normal que é 46.
A aneuploidia pode afetar cromossomos autossômicos ou cromossomos sexuais e, às vezes, pode causar sérias conseqüências. Uma das aneuploidias mais conhecidas é a síndrome de Down (ou trissomia do 21 ), que é caracterizada pela presença de outro cromossomo 21 autossômico além dos dois cânones.